層流手術室要求要有高潔凈度的空氣，并且還要能夠控制氣流的流通方向來使層流手術室內形成一個正壓的環境，這樣才可以使得氣流從潔凈度高的手術區域向潔凈度低的手術區域流動，氣流都是勻速流向同一方向的，也可以將空氣中的塵埃以及細菌給帶走。

  目前來說，層流手術室分為垂直層流式和水平層流式兩種。

  垂直層流式是指將高效過濾器安裝在手術病床的正上方，這樣可以保證氣流垂直吹送，而回風口通常設立在墻面的四角，這樣一來可以確保手術臺的潔凈度達到標準，一般來說醫院多采用垂直層流式的效果會比水平層流式的效果好。在層流手術室的頂部還可以設立一個吊塔式的負壓吸引系統，這樣就保證把醫生在手術時所呼出的空氣都吸收，從而更加保證手術室內的潔凈和無菌，降低了手術的感染率。